倒置荧鲜明微镜是一种特殊的显微镜，是在通俗透镜显微镜的基础上生长而来的。与通俗透镜显微镜差异的是，倒置荧鲜明微镜的横梁在物镜与标本之下，而不是在标本之上。这种设计使得标本更容易部署，便于考察。
倒置荧鲜明微镜稀奇适合于大型的生物标本和细胞培育物。它可以考察三维细胞培育物和完整的组织样本，不仅使得考察加倍清晰，也不会对细胞发生损害。
倒置荧鲜明微镜在生物医学领域的应用异常普遍。它可以被用于细胞培育，组织学研究，生物物理学，病理学以及药理学等领域。在疾病预防和治疗方面，倒置荧鲜明微镜也施展着重要的作用。
